m6A修飾圖譜構建及作用機制：通過m6A甲基化測序（MeRIP-Seq,miCLIP）構建疾病細胞模型或者發(fā)病組織的m6A修飾譜，分析m6A的motif,peaks數(shù)量及分布，Peak關聯(lián)基因的特征，聯(lián)合RNA-seq研究m6A甲基化與表達的關系。m6A研究思路方案一方案二研究案例1、.(IF=)為研究ALKBH5的m6A作用機制，作者利用芯片和m6A-seq篩選到膠質瘤增殖相關的FOXM1，通過qPCR、WB、免疫熒光、核質分離WB/qPCR、RIP和MeRIP等實驗證明ALKBH5通過去甲基化調節(jié)FOXM1在GSCs中的表達。為研究ALKBH5對FOXM1的作用是否受其他因子的調節(jié)，作者研究了FOXM1的鄰近基因，發(fā)現(xiàn)lncRNAFOXM1-AS與FOXM1序列互補，且共表達、共定位，進一步通過RIP,RNApulldown等實驗證明lncRNAFOXM1-AS促進ALKBH5和FOXM1初級轉錄本的相互作用。通過細胞實驗進一步驗證ALKBH5在lncRNAFOXM1-AS的作用下維持FOXM1的表達和細胞增殖，從而維持GSCs的干性。圖3ALKBH5敲除細胞中m6A修飾的特征和基因表達的變化2、RNAN6-methyladenosinemethyltransferaseMETTL3promoteslivercancerprogressionHepatology,2017.(IF=)表觀遺傳改變極大地促進了人類癥的發(fā)生。傳統(tǒng)的表觀遺傳研究主要集中在DNA甲基化，組蛋白修飾和染色質重構。近。常見的5種實驗動物取血方式，你掌握幾種？云南兔科研技術服務服務

原理HE染色主要使用蘇木精和伊紅這兩種染液，其中蘇木精堿性染液為藍色，可以將組織的酸性結構染成藍紫色（細胞核呈現(xiàn)藍色；軟骨基質、鈣鹽顆粒呈深藍；粘液呈灰藍）；伊紅是一種化學合成的酸性染料，在水中解離成帶負電荷的陰離子，易于蛋白質氨基中的正電荷結合使細胞漿染色。細胞漿、肌肉、結締組織、嗜伊紅顆粒等被染成不同程度的紅色或粉紅色。材料與儀器小鼠、固定液、酒精、二甲苯、石蠟、蜂蠟蘇木精染液、伊紅酒精溶液、鹽酸酒精溶液甘油蛋白粘片劑、中性樹膠石蠟包埋機、切片機、恒溫箱、蠟杯酒精燈、解剖剪、培養(yǎng)皿、鑷子、單面刀片染色缸、蓋玻片、載玻片、玻片盤、顯微鏡溫度計、水浴鍋步驟一、制作卵巢石蠟切片1、取材小鼠腹腔注射戊巴比妥鈉（50mg/kg）進行麻醉，頸椎脫臼法處死小鼠，取出雙側卵巢。取下所需組織，切成一小塊3~4mm厚。2、固定、洗滌、脫水（1）將切好的卵巢組織用生理鹽水洗一下，使用中性福爾馬林固定液固定30~50min。后用流水沖洗3次，每次5min。（2）卵巢組織依次經(jīng)70%、80%、90%乙醇溶液脫水，各30min。（3）再放入95%、100%乙醇溶液各2次，每次20min。3、透明、透蠟（1）使用純酒精、二甲苯等量混合液處理組織15min。廣西科研技術服務技術可以幫助科研人員深入理解疾病的共同性，即不同物種之間存在的共有病理變化過程。

外泌體生物發(fā)生和神經(jīng)元細胞中分泌小泡的調節(jié)之間的交集為外泌體和神經(jīng)退行性疾病的發(fā)病機制之間假定的聯(lián)提供了新的見解。與研究外泌體在其他疾病中的作用相比，外泌體中的研究進展迅速，而且外泌體與的幾個主要特征有關。外泌體影響、生長和轉移、副綜合征和耐藥性。外泌體在進展中的作用可能是動態(tài)的，并且與的類型、遺傳學和分期有關。外泌體的應用外泌體用于免疫基于免疫細胞來源的外泌體能夠介導和調節(jié)機體對的免疫反應，外泌體在免疫方面的潛力受到關注。其中樹枝狀細胞產(chǎn)生的外泌體包含大量的MHC-多肽復合物和免疫刺激相關的分子，能夠相關的T細胞，介導體內抗應答，在多個臨床試驗中表現(xiàn)出良好的抗療效。有研究者考察了樹枝狀細胞外泌體對非小細胞肺患者的療效。結果表明，患者對樹枝狀細胞外泌體耐受性良好，1/3患者表現(xiàn)出了對樹枝狀細胞外泌體的T細胞響應，2/4患者自然殺傷細胞活性得以。另有研究者公布了利用自體樹突狀細胞外泌體免疫轉移性黑色素瘤的臨床一期試驗結果，發(fā)現(xiàn)自體樹突狀細胞外泌體無明顯毒性，并且具有刺激自然殺傷細胞的能力。以上臨床試驗證明了外泌體免疫療法的安全性和可行性，為進一步臨床研究奠定了基礎。

3）基因/蛋白質表達定性或定量檢測在進行分子檢測的過程中，保持核酸和蛋白質的完整性至關重要，因此在取樣過程中，應盡量避免核酸及蛋白質的降解。如不注意采樣過程，將會導致樣本中的核酸及蛋白質的無差別降解，嚴重影響后續(xù)分子檢測結果。在條件允許的情況下，樣本在離體后應立刻裝入凍存管內，并立即放入液氮中進行冷凍。在RNA提取樣本的保存過程中，可以選擇非冷凍型RNA保存液或Trizol試劑進行RNA酶的。針對蛋白質提取樣本的保存，我們同樣可以使用商品化的蛋白酶劑進行短期處理。聚合酶鏈式反應（PolymeraseChnReaction，PCR）及免印跡（Westernblotting，WB），這兩種實驗手段是分子學檢測中不可或缺的一部分，也是發(fā)表至關重要的分子檢測數(shù)據(jù)。PCR主要用來對基因在基因組層面或轉錄層面的變化進行定性或定量檢測，而WB則主要用來對某一蛋白質的表達進行定量檢測。（4）轉錄組學、蛋白質組學及代謝組學檢測隨著檢測水平及相關產(chǎn)業(yè)的不斷發(fā)展，各類組學檢測的價格降低，實驗設計中也常常運用組學檢測來提升實驗設計的檔次。在我們進行轉錄組學及蛋白質組學的檢測過程中，同樣是要首先確保目標RNA或蛋白質的片段完整性。細胞器是細胞內的各種功能結構，如線粒體、內質網(wǎng)、高爾基體等，它們各自承擔著不同的生理功能。

RNA甲基化修飾（m6A）研究RNA甲基化修飾約占所有RNA修飾的60%以上，而N6-甲基腺嘌呤（N6-methyladenosine,m6A）是高等生物mRNA和lncRNAs上為普遍的修飾。目前發(fā)現(xiàn)microRNA，circRNA,rRNA,tRNA和snoRNA上都有發(fā)生m6A修飾。m6A修飾主要發(fā)生在RRACH序列中的腺嘌呤上，其功能由“編碼器(Writer)”、“消碼器(Eraser)”和“讀碼器(Reader)”決定[1]。“編碼器(Writer)”即甲基轉移酶，目前已知這個復合物的成分有METTL3，METTL14,WTAP和KIAA1429；而ALKBH5和FTO作為去甲基酶（消碼器）可逆轉甲基化；m6A由m6A結合蛋白識別，目前發(fā)現(xiàn)m6A結合蛋白（讀碼器）有YTH結構域蛋白（包括YTHDF1,YTHDF2,YTHDF3，YTHDC1和YTHDC2）和核不均一蛋白HNRNP家族（HNRNPA2B1和HNRNPC）。m6A酶系統(tǒng)METTL3是早先被鑒定為結合SAM的組件，其缺失引起小鼠胚胎干細胞、Hela細胞和HepG2細胞中m6Apeaks的減少。METTL3及其同源蛋白METTL14定位在富含剪切因子的細胞核內亞細胞器－核小斑（Nuclearspeckle）上，顯示ｍ６Ａ修飾可能和ＲＮＡ的剪切加工相關。WTAP與METTL3–METTL14二聚體相互作用，并共定位于核小斑，影響甲基化效率，參與mRNA剪。而KIAA1429作為候選的甲基轉移酶復合體的新亞基。免疫系統(tǒng)，人體的免疫系統(tǒng)由免疫細胞、免疫分子構成。外包科研技術服務構建

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m6A研究又有新手段了？趕緊來了解一下吧！欄目：研究動態(tài)發(fā)布時間：2019-08-14RNA甲基化m6A是如今的研究熱點之一,Cell上新發(fā)表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測mRNAm6A水平的Resource文章......RNA甲基化m6A是如今的研究熱點之一，目前主要的研究思路包括差異表達的write，reader和eraser基因分析；m6A抗體檢測全轉錄組甲基化水平；分析m6A甲基化水平變化的靶基因和下游機制研究。而在7月25日的Cell上新發(fā)表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測mRNAm6A水平的Resource文章，小編時間和大家分享一下。作者開發(fā)這一方法的前提是有研究報道了MazF能特異性的識別無修飾的ACA序列并發(fā)揮RNA酶活性在ACA之前剪切底物。但ACA序列的個A發(fā)生m6A甲基化之后將無法被MazF所識別，如圖一所示。圖1MazFRNA酶作用示意圖根據(jù)這一原理，作者將純化后的mRNA進行MazF酶處理，然后再對打斷的RNA進行逆轉建庫測序。對于無修飾的位點，ACA處被完全剪切，測序reads正好分布于該位點上下游而且比對至該處的上下游reads數(shù)是相同的.如圖2所示。而甲基化位點的reads會包含上下游的序列。作者開發(fā)了MAZTER-MINE軟件包專門進行分析（圖3）。云南兔科研技術服務服務